감면·공제

연말에 돌아가신 부모님 병원비를 다음 해에 냈다면 의료비 공제되나요?

글쓴이 허진영 변호사 · 법무법인 윤성2026.10.11 갱신

네, 12월 31일에 돌아가신 부모님의 병원비를 다음 해에 냈다면 그 돈을 낸 해의 연말정산에서 의료비 세액공제를 받을 수 있습니다. 국세청은 기본공제대상자였던 부양가족을 위해 쓴 의료비는 지출한 해에 공제한다고 해석했습니다. 병원 영수증의 수납일과 결제한 카드 명의부터 확인해 보십시오.

돌아가신 해에 병원비를 내지 못했으니 공제는 어디서도 받을 수 없다고 포기할 필요는 없습니다. 연말에 돌아가신 부모님의 병원비를 다음 해에 냈다면 그 돈을 낸 해의 연말정산에서 의료비 세액공제를 받을 수 있습니다.

이런 상담이 많습니다

직장인 D씨의 어머니는 2024년 12월 중순 입원했다가 12월 31일 병원에서 돌아가셨습니다. 장례를 치르느라 입원비와 치료비 약 640만원은 2025년 1월 초에 D씨가 자기 카드로 병원에 냈습니다. 2026년 1월 2025년 귀속 연말정산을 하면서 회사 담당자는 어머니가 2025년에는 부양가족이 아니어서 공제할 수 없다고 했습니다. D씨는 2024년에도, 2025년에도 공제를 못 받는 것이 맞는지 물었습니다. (상담 사례를 바탕으로 날짜와 금액을 바꿔 재구성한 예시입니다.)

돌아가신 부모님 병원비를 다음 해에 내면 공제되나요?

네, 연말에 돌아가신 부양가족의 병원비를 다음 해에 냈다면 그 돈을 낸 과세연도의 연말정산에서 의료비 세액공제를 받을 수 있습니다. 공제받는 해는 병원비를 실제로 낸 해입니다.

2026. 10. 11. 기준 현행 「소득세법」 제59조의4 제2항은 근로소득이 있는 거주자가 기본공제대상자를 위하여 해당 과세기간에 의료비를 지급한 경우 그 금액의 100분의 15를 공제한다고 정합니다. 의료비 공제에서 기본공제대상자는 나이와 소득 제한을 받지 않습니다.

문제는 낸 해에 부모님이 이미 기본공제대상자가 아니라는 점입니다. 부양가족 여부는 과세기간 종료일 현재로 판단하고, 그 전에 돌아가신 분은 사망일 전날 상황으로 판단합니다. 그래서 돌아가신 해에는 부양가족이지만, 다음 해에는 부양가족이 아닙니다.

국세청은 연말 사망 의료비를 어떻게 해석했나요?

국세청은 12월 31일 사망한 기본공제대상자였던 부양가족의 의료비를 다음 해에 지출했다면 지출한 과세연도 연말정산의 공제대상 의료비에 포함된다고 회신했습니다(사전-2019-법령해석소득-0046, 2019. 2. 15.). 질의자의 어머니는 연말에 입원했다가 그해 말 돌아가셨고 병원비는 다음 해 1월에 수납된 경우였습니다.

국세청은 문언대로 보면 사망한 해에는 낸 의료비가 없고, 낸 해에는 기본공제대상자가 없어 어느 해에도 공제를 못 받게 된다고 보았습니다. 이는 부양가족을 위해 쓴 의료비를 지원하는 공제 취지에 맞지 않으므로, 기본공제대상자였던 부양가족을 위해 쓴 의료비는 지출한 해에 공제한다고 해석했습니다.

이 회신은 12월 31일에 돌아가신 사실관계를 전제로 한 것입니다. 연중에 돌아가시고 그 병원비를 다음 해에 냈다면 같은 결론이 나오는지는 사망일과 지급일을 놓고 따로 확인해야 합니다.

위 사례의 공제액은 얼마인가요?

D씨의 2025년 총급여가 6천만원이라면 의료비 중 총급여의 100분의 3인 180만원을 넘는 금액이 공제 대상입니다. 병원비 약 640만원에서 180만원을 빼면 약 460만원이고, 그 100분의 15인 약 69만원을 세액에서 뺍니다.

어머니가 그해 65세 이상이었다면 한도 없는 의료비로 볼 수 있는지가 쟁점이 될 수 있습니다. 일반 부양가족 의료비는 공제 대상 금액이 연 700만원 한도이고, 본인·65세 이상·장애인 등을 위한 의료비는 한도가 없습니다. 돌아가신 다음 해에 나이 요건을 어떻게 보는지는 해석이 없으므로 일반 한도로 계산해 두는 것이 안전합니다.

상속재산으로 병원비를 냈다면 어떻게 되나요?

돌아가신 분의 예금 같은 상속재산으로 병원비를 냈다면 근로자가 지급한 의료비로 보기 어려워 의료비 세액공제 대상이 되지 않습니다. 공제는 근로소득이 있는 자녀가 자기 돈으로 낸 금액에 대해서만 받습니다.

그 대신 사망 당시 남아 있던 병원비는 피상속인의 채무입니다. 상속세 신고를 한다면 상속재산에서 뺄 채무로 반영할 수 있는지 함께 검토합니다. 같은 돈을 두 곳에서 모두 빼지 않도록 누가 어느 재원으로 냈는지 영수증과 이체 내역을 남겨 둡니다.

사망 부양가족 의료비 공제 대응 순서

• 지급 내역 확인 - 병원 영수증의 수납일과 결제한 카드·계좌 명의를 확인합니다. 근로자 본인이 낸 금액만 공제 대상입니다.
• 사망일 확인 - 기본증명서로 사망일을 확인하고, 사망한 해에 부양가족으로 기본공제를 받았는지 봅니다.
• 연말정산 반영 - 낸 해의 연말정산 때 의료비지급명세서와 소득·세액 공제신고서에 넣습니다. 간소화 자료에 빠져 있으면 병원 영수증을 직접 냅니다.
• 누락분 정정 - 연말정산에서 빠뜨렸다면 5월 종합소득세 확정신고로 넣거나 과세표준 및 세액의 결정(경정)청구서를 냅니다.
• 거부 시 불복 - 경정청구를 거부하는 통지를 받으면 그날부터 90일 안에 심판청구를 낼 수 있습니다. 이의신청은 선택 절차입니다.

여기까지는 일반 기준이고, 형제자매가 병원비를 나눠 냈거나 다른 형제가 부모님을 부양가족으로 공제받았다면 누가 공제받을지를 따로 따져야 합니다. 법무법인 윤성은 연말정산 누락분 경정청구와 상속세 신고 자문 업무를 수행합니다.

이 상황에서 자주 묻는 것

• 돌아가신 해에 부모님 기본공제는 받나요?
  네. 과세기간 종료일 전에 돌아가신 분은 사망일 전날 상황으로 부양가족 여부를 판단하므로, 그해 소득 요건 등을 갖췄다면 돌아가신 해에 기본공제를 받을 수 있습니다. 다음 해에는 기본공제대상자가 아닙니다.
• 12월 31일이 아니라 11월에 돌아가셨다면요?
  국세청 회신은 12월 31일 사망을 전제로 한 것입니다. 연중에 돌아가시고 병원비를 다음 해에 냈다면 같은 취지가 적용될 여지는 있지만 확인된 해석은 아니므로, 사망일과 수납일을 놓고 개별적으로 검토해야 합니다.
• 의료비 공제는 얼마나 받나요?
  총급여의 100분의 3을 넘는 의료비의 100분의 15를 세액에서 뺍니다. 일반 부양가족 의료비는 공제 대상 금액이 연 700만원까지이고, 본인·65세 이상·장애인 등을 위한 의료비는 한도가 없습니다.
• 형제가 나눠 냈으면 각자 공제받나요?
  의료비 공제는 그 부모님을 기본공제대상자로 하는 근로자가 낸 금액에 대해 받는 것이 원칙입니다. 형제가 나눠 냈다면 누가 기본공제를 받았는지, 각자 실제로 얼마를 냈는지를 함께 따져야 하므로 영수증 명의를 확인하십시오.
• 부모님 예금으로 낸 병원비는요?
  돌아가신 분의 상속재산으로 낸 병원비는 근로자가 지급한 의료비로 보기 어려워 의료비 세액공제 대상이 아닙니다. 이때는 피상속인의 채무로 상속세 계산에 반영할 수 있는지를 검토합니다.
• 연말정산에서 빠뜨렸으면 어떻게 하나요?
  다음 해 5월 종합소득세 확정신고 때 의료비를 넣어 신고하면 됩니다. 이미 기한이 지났다면 법정신고기한이 지난 후 5년 안에 경정청구로 공제를 반영해 달라고 할 수 있습니다. 병원 영수증과 결제 내역을 첨부합니다.
• 회사가 공제를 거부하면 끝인가요?
  아닙니다. 회사 연말정산에서 빠진 공제는 근로자가 직접 종합소득세 신고나 경정청구로 받을 수 있습니다. 경정청구가 거부되면 통지를 받은 날부터 90일 안에 심판청구를 낼 수 있습니다.

법무법인 윤성 × Lexle

허진영 변호사법무법인 윤성 대표변호사대한변호사협회 등록 조세 전문변호사 · 세무사 등록

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